农业农村部儋州木薯种质资源圃位于海南省儋州市宝岛新村（东经109°30′、北纬19°30′，年均气温23.1℃，年均降雨量1823 毫米）。儋州木薯种质资源圃依托单位为中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所，始建于1963年，2009年由农业部正式认定并授牌“农业部儋州木薯种质资源圃”，面积为103亩，建有综合实验室、组织培养实验室以及蛋白质组学实验室，田间道路、晒场、多功能网室、排灌设施、周边防护围栏等配套设施， 2000年至今，通过与国际热带农业研究中心（CIAT）、泰国农业部、巴西国家农牧研究院（EMBRAPA）和尼日利亚农业部等合作，收集、保存了泰国、越南、巴西、哥伦比亚等国内外木薯核心种质资源837份，引进国外特异种子10余万粒；现有固定研究人员21人，其中博士7人，硕士10人，包括研究员3人，副研究员6人，助理研究员7人，稳定的人才队伍为种质资源研究提供的有力的保障。
种质圃多年来，先后承担了国家科技部、农业部、南亚办等相关部门的重大项目，包括“973”项目、“863”项目、“948”项目、国家木薯产业技术体系项目，国家自然科学基金项目、木薯行业科技项目、跨越计划项目、国家科技支撑计划项目、国家外专局项目和农业行业科技专项等。2009年，“木薯品种选育及产业化关键技术研发集成与应用”获国家科学技术进步奖二等奖。2013年，木薯种质资源收集、保存及应用研究团队荣获农业部“全国农业先进集体”光荣称号。
种质圃主要开展木薯种质资源的收集、保存、评价和创新利用研究，按照国家要求，对木薯国内外种质有计划地进行收集、整理、鉴定、保存、编目、共享和利用，制定及完善木薯种质资源特性描述规范和数据标准，构建我国木薯种质资源收集、保存、整理、评价技术体系，为全国木薯育种、生产和其他科研需要服务，先后选育出自主创新的“华南6068”、“华南8013”、“华南8002”、“华南124”、“华南5号”、“华南6号”、“华南7号”、“华南8号”、“华南9号”、“华南10号”、“华南11号”、“华南12号”、“华南13号”、“华南14号”等具有高产、高淀粉、抗逆性强、食用、耐采后生理腐烂等特性华南系列木薯新品种14个。培育优良品系5518个，具有花叶木薯、水果木薯等特异资源。近5年主要向29家国内外科研、高等院校等单位提供木薯种质资源共2027份次。
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